三明市第二医院创建于1937年，是一所融医疗、教学、科研、康复、预防为一体的“三级乙等”综合性医院，担负着永安市及周边四个县120多万人口的医疗任务和危重病人的抢救。年门诊量近30万人次，年住院量1万余人次。
2003年11月9日，福州铁路分局与三明市政府签订协议，正式将原永安铁路医院移交市政府，并将其并入三明市第二医院，更名为三明市第二医院东院。目前，医院总占地面积73400平方米，建筑总面积74249平方米，固定资产11466万元。编制床位660张，设置近50个业务科室，26个专业组，3个研究所。现有在职职工686人，其中高级职称人员53人，中级职称人员153人。
三明市第二医院是福建省教育厅、卫生厅首批确认的“福建省高等医学院校临床教学基地”之一，担负着福建医科大学、福建中医院、江西赣南医学院的学生实习教学任务。医院在骨科、神经外科、显微外科、肿瘤科、妇产科、神经内科、呼吸内科、血液内科、心内科、肾内科、脉管炎科、中医科、口腔外科、高压氧医学、介入疗法、微创手术等专业方面具有一定的特色。近几年来，医院先后添置了全身CT机、全自动生化分析仪、彩色多普勒超声显像仪、人工肾机、体外震波碎石机、全自动微粒子化学发光免疫分析仪、电子胃镜、肠镜、腹腔镜、关节镜、电切镜等系列腔镜、数字胃肠减压X光机、核磁共振、螺旋CT等万元以上先进的大型医疗设备230多台（件）。
三明市第二医院先后建立了三明市心脏病研究所、三明市肾脏病研究所、三明市中国蛇协血栓病防治中心、永安创伤急救中心、永安中心血库、三明市永安急救中毒站、三明市介入医学诊疗中心、永安同济肿瘤研究所。
三明市第二医院坚持以病人为中心，以质量为核心，一手抓医疗质量管理，一手抓医德医风教育，两个文明建设取得丰硕成果。在科研方面，每年开展新技术、新项目30多项，有45项科研项目获全国科学大会奖、省地科技成果奖。先后获得全国卫生先进集体、全国“百佳医院”、全国行风建设先进集体、创建全国文明行业先进单位、省级文明单位、福建省职业道德“十佳”先进集体荣誉称号，并被国家卫生部认定为国际紧急救援中心网络医院，并纳入永安市和三明市三明市医疗保险定点医院，其中永安市医保患者70%到我院诊治。